小腸球蟲(chóng)的感染是本病的主要原因之一。小腸球蟲(chóng)主要寄生于腸粘膜上皮細胞中，當其大量生長(cháng)繁殖時(shí)，必然導致腸粘膜增厚，水腫，嚴重脫落及出血等病變，則幾乎使飼料不能被完全消化吸收，同時(shí)對水分的吸收也明顯減少，盡管雞大量飲水，也會(huì )引起脫水現象，所以發(fā)病雞群所排的糞便就很稀薄且不成形，內含有沒(méi)有被消化的飼料。

 

　　細菌能引起腸炎，也是肉雞腸毒綜合癥的病因之一：如沙門(mén)氏菌、產(chǎn)氣夾膜梭菌等，通過(guò)刺激破壞腸道黏膜，同時(shí)引起炎癥使腸蠕動(dòng)速度加快，消化液排泄過(guò)多，飼料通過(guò)消化道的時(shí)間縮短，導致消化不良。

 

　　病毒也是引起腸毒綜合癥的誘因之一；如呼腸弧病毒引起腸炎，損害腸道的吸收功能。

 

　　由于季節、飼料、病原微生物等原因引起腸道菌群失調，產(chǎn)生大量乳酸，使腸道內PH值嚴重降低，腸道內環(huán)境發(fā)生改變，有益菌減少有害菌大量繁殖，又由于此時(shí)腸道處于厭氧環(huán)境，魏氏梭菌、腸梭菌等厭氧菌會(huì )大量繁殖，有害菌與球蟲(chóng)相互協(xié)調而加強了致病性。這樣就會(huì )造成有益菌減少，而有害菌大量生長(cháng)繁殖，特別是大腸桿菌、沙門(mén)氏菌能加重致病性。菌群所分泌的毒素增多，刺激腸道粘膜使腸蠕動(dòng)加快，消化液排出增多，飼料通過(guò)腸道的時(shí)間縮短，消化不良，未消化的飼料隨同脫落的粘膜一起排出體外，形成特征性的西紅柿樣或魚(yú)腸樣糞便。

 

　　由于球蟲(chóng)和有害菌大量生長(cháng)繁殖導致消化不良和腸道吸收障礙，使電解質(zhì)吸收減少，同時(shí)，由于大量的腸粘膜細胞迅速破裂崩解，使電解質(zhì)大量流失，出現生理生化障礙，特別是鉀離子的大量流失，會(huì )導致心臟的興奮性過(guò)度增強，這也是肉雞猝死癥明顯增多的主要原因之一。

 

　　在發(fā)病的過(guò)程中，大量的腸道上皮細胞破裂，在細菌的作用下，發(fā)生腐敗分解，以及脫落的腸粘膜、死亡的蟲(chóng)體等在體內發(fā)酵分解產(chǎn)生大量有毒物質(zhì)，同時(shí)，腸道內異常菌群分泌的毒素均會(huì )被機體吸收后發(fā)生自體中毒，出現興奮不安、尖叫、癱瘓而衰竭死亡等癥狀。

 

　　飼料中大量的能量、蛋白質(zhì)和部分維生素能促進(jìn)細菌與球蟲(chóng)的大量繁殖，加重癥狀。所以營(yíng)養越豐富，發(fā)病率就越高，癥狀就越嚴重。而飼喂品質(zhì)較低的飼料相對發(fā)病較低。另外霉變飼料也能加重病。

 

　　長(cháng)期用藥，使藥物對腸道粘膜造成損傷，引發(fā)腸炎。